Centrum Genetyczne

Metoda jednostopniowa to najnowocześniejsza metoda szacowania wartości hodowlanej bydła. Jest to sposób szacowania wartości hodowlanych, w którym wszystkie zwierzęta są ocenione jednocześnie z użyciem wszystkich źródeł informacji. 

Metoda jednostopniowa (lub jednego kroku – z ang. single-step) została opracowana przez zespół naszego rodaka, prof. Ignacego Misztala, w 2009 roku na Uniwersytecie w Georgii w USA jako równanie matematyczne pozwalające na połączenie informacji rodowodowej z genomową. W kolejnych latach zespół prof. Misztala ulepszał metodę, tak by mogła uwzględnić w obliczeniach setki tysięcy zgenotypowanych zwierząt.

Ocena ta pozwala na jednoczesną ocenę zwierząt zgenotypowanych i niezgenotypowanych. Umożliwia połączenie wszystkich dostępnych źródeł informacji o zwierzęciu: fenotypowych obserwacji własnych (w przypadku samic) i pochodzących od krewnych, międzynarodowych ocen wartości hodowlanej buhajów, powiązań rodowodowych oraz informacji o genotypach zwierząt. Dla osobników zgenotypowanych możemy liczyć na zdecydowanie wyższą dokładność oceny. Z kolei wartości hodowlane dla osobników niezgenotypowanych będą charakteryzować się niższą dokładnością, chyba że są dostępne dla nich obserwacje własne lub obserwacje na wielu córkach. 

Metoda jednostopniowa pozwala na zwiększenie dokładności oceny, a zatem przyspieszenie postępu hodowlanego w polskiej populacji przy jednoczesnym ograniczeniu wpływu preselekcji buhajów na wyniki ich oceny. 

Nowoczesna metoda wprowadzana na świecie

Kolejne kraje przechodzą z dotychczas stosowanych metod szacowania oceny konwencjonalnej i genomowej wartości hodowlanej na nowoczesną, jednostopniową ocenę wartości hodowlanej. Metoda jednostopniowa została z powodzeniem wdrożona w takich krajach jak Francja, Holandia, Kanada, a prace nad jej wprowadzeniem trwają również w innych krajach zrzeszonych w spółdzielni EuroGenomics oraz w USA. 

O doświadczeniach związanych z tym procesem można było usłyszeć od prelegentów tegorocznego Forum Genetycznego. Nagranie z wykładu otwierającego VI Forum Genetyczne wygłoszone przez  prof. Ignacego Misztala można obejrzeć pod linkiem.

W Polsce już wdrożyliśmy ocenę jednostopniową 

W kwietniu 2024  roku do oficjalnej oceny wartości hodowlanej została włączona odporność na dermatitis digitalis. Do szacowania wartości hodowlanych użyto danych zebranych w ramach projektu “CGen korekcja” i  wykorzystano metodę jednostopniową. Mamy więc już roczne doświadczenie w wykorzystywaniu tej metodyki i publikowaniu wyników.

Podobnie w innych krajach tę metodę wdraża się najpierw dla nowych cech, a w kolejnym kroku przenosi się na nią  wszystkie oceniane cechy. Przykładem może być Kanada, która początkowo stosowała metodę jednostopniową tylko do oceny genetycznej nowych cech. Bogatsi o to doświadczenie mogli przystąpić do zmiany systemu i wdrożenia metody jednostopniowej dla wszystkich cech ocenianych w tym kraju. 

Aktualizacja systemu oceny – nie tylko metoda, ale też nowe definicje cech

Wdrażanie nowego systemu oceny pozwoliło na zastosowania zmian w modelach wynikających z zaleceń tzw. złotego standardu Spółdzielni EuroGenomics. Wytyczne te określają sposób edycji i filtrowania danych oraz listę efektów i sposób modelowania dla poszczególnych grup cech. 

Ponadto stało się okazją do poszerzenia zakresu ocenianych cech (opracowanie oceny dla dodatkowej cechy płodności czyli okresu usługi) oraz pozwoliło na aktualizację sposobu definiowania w odniesieniu do długowieczności. 

Potwierdzenie z Interbull 

Wyniki uzyskane z nowego systemu oceny jednostopniowej przeszły testy walidacyjne prowadzone przez Interbull dla wszystkich cech uwzględnianych w ocenie międzynarodowej. Ważną kwestią jest również wzrost zgodności oceny buhajów z oceną prowadzoną w innych krajach europejskich oraz USA i Kanadzie. Korelacje oszacowane przez Interbull w ramach testu wykazały, że nowy system oceny znacznie lepiej koreluje z oceną w innych krajach. Jest to bardzo ważne, gdyż wskazuje jednoznacznie, że ocena genetyczna buhajów na podstawie nowej krajowej oceny jednostopniowej jest bardziej zbieżna z oceną tych samych buhajów pochodzącą z oceny prowadzonej w krajach takich jak Niemcy, Francja, Holandia czy USA. 

Co zyskają Polscy hodowcy dzięki wprowadzeniu oceny jednostopniowej

Metoda jednostopniowa niesie ze sobą wiele korzyści, dla każdego hodowcy prowadzącego pracę hodowlaną w swoim stadzie. Podejmowane na jej podstawie decyzje będą trafniejsze, gdyż uzyskiwane wyniki będą wiarygodniejsze, będa obejmowały większą grupę zwierząt, które bedzie można łatwiej ze sobą porównywać.

• podnosi wiarygodność oceny wartości hodowlanej

Uzyskanie oceny o wyższej dokładności jest możliwe dzięki pełniejszemu wykorzystaniu wszystkich dostępnych danych o zwierzęciu i znacznemu uproszczeniu procesu szacowania wartości hodowlanej. Oznacza to niejako większe urealnienie uzyskiwanych dotychczas ocen bo wzrost wiarygodności to precyzyjniejsze zbliżenie się do rzeczywistego potencjału genetycznego zwierzęcia. Wartości hodowlane obliczone z dużą dokładnością są narażone na mniejsze ryzyko zmian w przyszłości, pewne wahania mogą się zdarzać, rzecz jasna, i dobrze się z nimi liczyć, podejmując decyzje hodowlane.

• ujednolica metodykę uzyskiwania wyników dla zwierząt o różnym zakresie dostępnych informacji (o różnych typach oceny w dotychczasowym systemie)

Ujednolicenie metodyki także przekłada się na większą stabilność oceny w czasie. Przy stosowaniu oceny konwencjonalnej i genomowej obserwujemy większą niż przeciętnie zmianę pomiędzy sezonami, w których zmienia się typ oceny zwierzęcia. Po wdrożeniu metody jednostopniowej ocena dla zwierzęcia będzie pochodziła z tego samego systemu niezależnie od tego jakie źródła informacji będą dla danej sztuki dostępne. Oczywiście dokładność oceny  będzie się zmieniała wraz z dochodzeniem kolejnych danych o zwierzęciu, ale nie będzie skoku związanego ze zmianą metody obliczeniowej.

Kolejną przewagą jednolitego systemu oceny jest łatwiejsze porównywanie zwierząt o różnych typach oceny pomiędzy sobą. Ponieważ dla każdego zwierzęcia  wynik będzie uzyskiwany w ten sam sposób to będzie można je zestawiać we wspólnych rankingach znacznie skuteczniej niż dotychczas.

• pozwala na uzyskanie wyników dla większej liczby zwierząt

Objęcie jednym systemem oceny zwierząt o różnym zakresie dostępnych informacji powoduje, że możliwe jest uzyskanie praktycznie kompletu wyników dla każdego z nich. Należy pamiętać, że będą występowały różnice w dokładności uzyskanych wartości hodowlanych, ale będą one wystarczające by policzyć wartość indeksu selekcyjnego dla większej grupy zwierząt niż dotychczas. 

Opublikowaliśmy grudniowe wyniki oceny wartości hodowlanej dla krów i jałówek rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej.

Zachęcamy do wyświetlania rankingów:

• najlepszych samic na bazie Indeksu Ekonomicznego (IE) lub indeksu PF. W tym rankingu znajdziesz krowy (ocenione konwencjonalnie lub genomowo) i jałówki (ocenione genomowo),
• najlepszych jałówek na bazie indeksu rodowodowego (rIE lub rPF),
• najlepszych stad na bazie indeksu rodowodowego (rIE lub rPF).

Są to ogólnodostępne rankingi dostępne ze strony: https://www.cgen.pl/indeksy/ 

Hodowcy genotypujący samice w Laboratorium Genetyki Bydła Polskiej Federacji Hodowców Bydła i Producentów Mleka mogą logować się do indywidualnych podsumowań genotypowania. Więcej informacji o tym narzędziu znajduje się na stronie: https://www.cgen.pl/podsumowanie-genotypowania/ 

Ranking EuroGenomics dla buhajów zostanie dodany po opublikowaniu kompletnych wyników przez EuroGenomics.

Wyniki przygotowane zostały według dotychczasowej metodyki, równolegle trwają prace nad obliczeniami według nowej – jednostopniowej metody oceny.

Zapraszamy do korzystania z rankingu najlepszych buhajów na stronie CGen

Opublikowaliśmy sierpniowe wyniki oceny wartości hodowlanej dla bydła rasy simentalskiej.

Wyniki najlepszych buhajów i samic tej rasy są dostępne w rankingach na stronie: https://www.cgen.pl/indeksy/ 

W jaki sposób wyświetlić wyniki indeksu PFSM? W menu rankingu w filtrze rasy/odmiany zmień domyślną pozycję „HO” na „SM”.

Opublikowaliśmy sierpniowe wyniki oceny wartości hodowlanej dla krów i jałówek rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej.

Zachęcamy do wyświetlania rankingów:

• najlepszych samic na bazie Indeksu Ekonomicznego (IE) lub indeksu PF. W tym rankingu znajdziesz krowy (ocenione konwencjonalnie lub genomowo) i jałówki (ocenione genomowo),
• najlepszych jałówek na bazie indeksu rodowodowego (rIE lub rPF),
• najlepszych stad na bazie indeksu rodowodowego (rIE lub rPF).

Są to ogólnodostępne rankingi dostępne ze strony: https://www.cgen.pl/indeksy/ 

Hodowcy genotypujący samice w Laboratorium Genetyki Bydła Polskiej Federacji Hodowców Bydła i Producentów Mleka mogą logować się do indywidualnych podsumowań genotypowania. Więcej informacji o tym narzędziu znajduje się na stronie: https://www.cgen.pl/podsumowanie-genotypowania/ 

Opublikowaliśmy wyniki sierpniowej oceny wartości hodowlanej buhajów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej. Ich wyświetlanie jest możliwe w rankingu najlepszych buhajów na stronie: www.cgen.pl/indeksy/ 

Polska Federacja Hodowców Bydła i Producentów Mleka prowadzi prace, które mają na celu aktualizację indeksów selekcyjnych dla rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej. Z tej racji przygotowana została ankieta dotycząca doskonalenia populacji, która odpowiada na oczekiwania hodowców.

Ankieta pozwoli poznać perspektywę hodowców i uwzględnić ją podczas opracowywania nowych formuł indeksów.  

Ankieta jest dobrowolna i anonimowa, a jej wypełnienie zajmuje nie więcej niż 25 minut. Całość składa się z 7 sekcji tematycznych:

1.       Informacje wstępne
2.       Jakie chcę mieć krowy w stadzie? 
3.       Jakie podindeksy mnie interesują?
4.       Które cechy wybieram? 
5.       Jakie nowe cechy są dla mnie ważne?
6.       Krowy, których chcę uniknąć w stadzie
7.       Jakie są główne przyczyny brakowania w moim stadzie?

Link do ankiety preferencji hodowlanych

Pierwszy etap zbierania odpowiedzi potrwa do 31.08.2024 roku. Mimo to, zwracamy się z prośbą o jak najszybsze wypełnienie ankiety. Umożliwi to przystąpienie do realizacji kolejnych etapów projektu. 

W przypadku problemów z wypełnieniem ankiety przez hodowcę, pracownicy PFHBiPM zapewnią wsparcie w uzupełnieniu formularza.

Wyniki oceny wartości hodowlanej z czerwca 2024 r. zostały udostępnione.

Można je znaleźć w ogólnodostępnych rankingach najlepszych jałówek i krów na bazie Indeksu Ekonomicznego (IE) oraz indeksu PF. Hodowcy mają dostęp do wyników swoich zwierząt w podsumowaniu genotypowania. Te narzędzia są dostępne pod adresem https://www.cgen.pl/indeksy/.